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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST039337
species: Chlamydomonas reinhardtii
source: miRBase, original name: cre-MIR1150 (MI0006211)

Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TCGCCGAGAGGGACATTGAT

miRNA*
CAATATCCCTCTTGGCGAGC

mismatches: 1
bulges: 0

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pre-miRNA
GGACGCGCAGCGGAGCAGATCCCCGTCATACCCCGCTTGGTGCAGCGCGTCAATATCCCTCTTGGCGAGCTTCGCAAATAGAGTCGGCCCCAGTTTCCGC
TGCAGCTGGGCTTCGTGCTTCCAGCTTCCTGCACGGCTCGCCGTCCGAGCGCCTTGCTTGCCGCCCGATACGCAGTTCGGATTCGTATACGCATATCGAA
CTCAATCCGAGTCGCGTATCATCGGGTGGCAAGGAAGGCGCTGGAAGCCTCTGACAGCGAGCCATGCAGGAAGCTGAAAGCCTGAAAGCCCACCTGCAGC
GGCGACTGGGGCCGACCCTGTTTGCAAAGCTCGCCGAGAGGGACATTGATGCGCTGCACCAAGCGGGGTATGACGGGGATACGCTCCGCTTCGCGTCC


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
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evidence: cloned

references

[1] Molnar A, Schwach F, Studholme DJ, Thuenemann EC, Baulcombe DC, Nature. 447:1126-1129(2007)., "miRNAs control gene expression in the single-cell alga Chlamydomonas reinhardtii"




Liczniki na strone;