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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST039338
species:
Chlamydomonas reinhardtii
source:
miRBase, original name:
cre-MIR1150
(
MI0006211
)
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii
Chlamydomonas
Chlamydomonadaceae
Chlamydomonadales
Chlorophyceae
Chlorophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
AGAGGGACATTGATGCGCTGC
miRNA*
AGCGCGTCAATATCCCTCTTG
mismatches:
1
bulges:
0
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pre-miRNA
GGACGCGCAGCGGAGCAGATCCCCGTCATACCCCGCTTGGTGC
AGCGCGTCAATATCCCTCTTG
GCGAGCTTCGCAAATAGAGTCGGCCCCAGTTTCCGC
TGCAGCTGGGCTTCGTGCTTCCAGCTTCCTGCACGGCTCGCCGTCCGAGCGCCTTGCTTGCCGCCCGATACGCAGTTCGGATTCGTATACGCATATCGAA
CTCAATCCGAGTCGCGTATCATCGGGTGGCAAGGAAGGCGCTGGAAGCCTCTGACAGCGAGCCATGCAGGAAGCTGAAAGCCTGAAAGCCCACCTGCAGC
GGCGACTGGGGCCGACCCTGTTTGCAAAGCTCGCCG
AGAGGGACATTGATGCGCTGC
ACCAAGCGGGGTATGACGGGGATACGCTCCGCTTCGCGTCC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
no hits
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
additional data
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evidence:
cloned
references
[
1
] Molnar A, Schwach F, Studholme DJ, Thuenemann EC, Baulcombe DC,
Nature. 447:1126-1129(2007).
,
"miRNAs control gene expression in the single-cell alga Chlamydomonas reinhardtii"