ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: miRBase, original name: osa-MIR806a (MI0005210)
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG miRNA* CCGTTGACTTTTTAAATACGTGT mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
TACGTATATACTCTCTCCGTTTCAAAATGTTTGACACCGTTGACTTTTTAAATACGTGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTTA
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HuntMi prediction: true miRNA
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evidence: cloned, Northern
references
[1] Luo YC, Zhou H, Li Y, Chen JY, Yang JH, Chen YQ, Qu LH, FEBS Lett. 580:5111-5116(2006)., "Rice embryogenic calli express a unique set of microRNAs, suggesting regulatory roles of microRNAs in plant post-embryogenic development"
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR806c: 2e-75 PMRD osa-miR806a: 4e-126 microPC miR806: 2e-41 | UniProt no hits RFAM MIR806: 3e-81 |
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[1] Luo YC, Zhou H, Li Y, Chen JY, Yang JH, Chen YQ, Qu LH, FEBS Lett. 580:5111-5116(2006)., "Rice embryogenic calli express a unique set of microRNAs, suggesting regulatory roles of microRNAs in plant post-embryogenic development"
