ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR812
source: miRBase, original name: osa-MIR1884b (MI0008281)
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AATGTATGACGCTGTTGACTTTTA miRNA* AAAGTCAACGGTGTCATATATTTA mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCTGTTTTTAAATGTATGACGCTGTTGACTTTTAGATATATGTTGACAATTCGTCTTATTCAAAAAATCGAGCAAATATAAAAATATAAGTGAGGCTTAA
GGTATATTTGATGATAAAACAAGTCATGGCAAAATTAATGATACCTGTATAACTTTTTTGAGTAAGACGAGTGGTCAAACGTAGATTTAAAAGTCAACGG
TGTCATATATTTATAAATGGA
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evidence: 454
references
[1] Zhu QH, Spriggs A, Matthew L, Fan L, Kennedy G, Gubler F, Helliwell C, Genome Res. 18:1456-1465(2008)., "A diverse set of microRNAs and microRNA-like small RNAs in developing rice grains"
TCTGTTTTTAAATGTATGACGCTGTTGACTTTTAGATATATGTTGACAATTCGTCTTATTCAAAAAATCGAGCAAATATAAAAATATAAGTGAGGCTTAA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1884a: 0.00000000005 PMRD osa-miR1884b: 8e-124 microPC miR1884: 0.00004 | UniProt sp|P0C282|SAP18_ORYSJ: 0.000003 RFAM MIR806: 0.00000000000001 |
Identical with: osa-miR1884b from PMRD (MNEST049190) |
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[1] Zhu QH, Spriggs A, Matthew L, Fan L, Kennedy G, Gubler F, Helliwell C, Genome Res. 18:1456-1465(2008)., "A diverse set of microRNAs and microRNA-like small RNAs in developing rice grains"
