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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST042379
species: Oryza sativa
source: miRBase, original name: osa-MIR2125 (MI0010723)

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTTTTCTCTATAGACTATCTCCAG

miRNA*
 TGAGATAGTCTATAGAGAAAAA

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 TTTTTCTCTATAGACTATCTCCAGGTTAATAGATAGCTTTGCTCTCTCTCTTCATTTAATCTCTTCCAAGTAGGAAAATATGCTGACATGGATCTCTTGT
AGAGAGTCTATAGATAACCATTGCAGGTGCCCTTATGCTTCCGTTGTTTGGAAATCAAGGTGACTACGTCATTCGTTTCCATCGCTTGATTAGGGCACCC
ACAATGGTTATCTGTAGGCTCTCTACAAAAGATCCATGTCAGCATATTTTTCTACTTGGAAGAGATTAAATGAAGAGAGAGAGCAAAGCTATCTACTAAT
TTTGAGATAGTCTATAGAGAAAAA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD osa-miRf10511-akr: 4e-68

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits

Identical with: osa-miRf10513-akr from PMRD (MNEST049728)

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
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evidence: cloned

references
[1] Huang SQ, Peng J, Qiu CX, Yang ZM, J Inorg Biochem. 103:282-287(2009)., "Heavy metal-regulated new microRNAs from rice"



Liczniki na strone;