ABOUT THIS RECORDspecies: Vitis vinifera
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Vitis vinifera Vitis Vitaceae Vitales rosids incertae sedis rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTC miRNA* GCTCCTTGAAGTCCAATAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTCTTACTGGGTAGATTGAGCTGCTGACTTATGGATCCCACAGCCCTATCCCGTCAATGGGGGGCATTGGATAGGC
TTGTGGCTTGCATATCTCAAGAGCTGCATTATCCAAGTTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC
dot-bracket secondary structure
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TTGTGGCTTGCATATCTCAAGAGCTGCATTATCCAAGTTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR159c: 6e-90 PMRD vvi-miR159c: 6e-90 microPC miR159: 2e-92 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-88 |
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