ABOUT THIS RECORDspecies: Vitis vinifera
miRNA family: MIR159
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Vitis vinifera Vitis Vitaceae Vitales rosids incertae sedis rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGGTCTTACTGGGTAGATTGAGCTGCTGACTTATGGATCCCACAGCCCTATCCCGTCAATGGGGGGCATTGGATAG
GCTTGTGGCTTGCATATCTCAAGAGCTGCATTATCCAAGTTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR159c: 3e-92 PMRD vvi-miR159c: 3e-92 microPC miR159: 1e-94 | UniProt no hits RFAM MIR159: 5e-91 |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046237) |
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