ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTC miRNA* GCTCCTTGAAGTCCAATAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGCTGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATCTCATAATAAAGACTCTAGTCTTCTTG
GATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTCTTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 2e-46 PMRD vvi-miR159c: 2e-28 microPC miR159: 1e-97 | UniProt no hits RFAM MIR159: 4e-45 |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST046712) |
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