ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
source: microPC, original name: miR1120
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTCTTATATTATGAAACGGAG miRNA* CCGTTTTATAATGTAAAACTTT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTCCGTTTTATAATGTAAAACTTTCTAGCATTGCCCACGTTCATTTATATGTTAATGAATCTAGATATATTTATGTGTTTAAATTCATTAACATCTATAT
GTATATGAGCAATGTTAGAAATTCTTATATTATGAAACGGAG
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR819j: 4e-29 PMRD osa-miR819j: 4e-29 microPC miR1132: 5e-22 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 8e-40 |
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