ABOUT THIS RECORDspecies: Liriodendron tulipifera
miRNA family: MIR319
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Liriodendron tulipifera Liriodendron Magnoliaceae Magnoliales magnoliids Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTTGGACTGAAGGGAGCTCC miRNA* AGCTCTCTTCAGTCCAGTCC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CGGAGCTCTCTTCAGTCCAGTCCAAGATAGTATTAAGCCAATCTCCGCTGCTGACTCGTTGGCTCATGAACTCATCCAACGGCTAGGATTCCGATGTGTTT
TTGATCCAACGATGCGGGAGCCGTGTTTGGTTCTGTCTGTCTCGTCTTGGACTGAAGGGAGCTCC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR319b: 1.0E-13 PMRD ltu-miR319: 2.0E-90 microPC miR319: 2.0E-90 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 3.0E-12 |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045356), ltu-miR319 from PMRD |
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