ABOUT THIS RECORDspecies: Populus alba x Populus tremula
miRNA family: MIR475
source: microPC, original name: miR475
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTACAGTGCCCATTGATTAAG miRNA* TGATCAATGGCCATTGTAAGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTTGATCAATGGCCATTGTAAGAGTAGAAGGATCCATGAAGCAATAACTCTCTTTGCTAAAATGTGTGATAAAACATTGACTCCTGGTATTTCACTCTTA
CAGTGCCCATTGATTAAG
dot-bracket secondary structure
((((((((((((.((((((((((((.((((...(((.(((((((.........)))))..(((((........)))))...)).)))..)))))))))))
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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CAGTGCCCATTGATTAAG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR475a: 1e-62 PMRD ptc-miRf10947-akr: 1e-62 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR475: 1e-35 |
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