ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* AGCTCCTTAAAGTTCAAAC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAACCTTAAACATAGAAAAAGGATTTT
GGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase aly-MIR159a: 8e-74 PMRD bra-miR159a: 8e-68 microPC miR159: 2e-99 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-65 |
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