ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* AGCTCCTTAAAGTCCAATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTTT
TCAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 1e-26 PMRD vvi-miR159c: 3e-21 microPC miR159: 5e-94 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-25 |
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