ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum subsp raphanistrum
miRNA family: MIR159
source: microPC, original name: miR159
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GGGCTCCTTATAGTTCAAACG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTG
GTAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 1e-75 PMRD bra-miR159a: 1e-75 microPC miR159: 2e-99 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-59 |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046710) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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