ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum subsp raphanistrum
source: microPC, original name: miR159
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GGGCTCCTTATAGTTCAAAC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTG
GTAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 1.0E-75 PMRD bra-miR159a: 1.0E-75 microPC miR159: 2.0E-99 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 2.0E-59 |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046710) |
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