ABOUT THIS RECORDspecies: Populus deltoides
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Populus deltoides Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTC miRNA* GCTCCTTGAAGTCCAATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGCCCTATCTATCAACTGAAGGATAGGTTTGCGGCT
TGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC
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GGGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGCCCTATCTATCAACTGAAGGATAGGTTTGCGGCT
TGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR159a: 5e-84 PMRD ptc-miR159a: 5e-84 microPC miR159: 1e-87 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-80 |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045079) |
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