ABOUT THIS RECORDspecies: Lotus corniculatus
miRNA family: MIR398
source: microPC, original name: miR398
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTGTTCTCAGGTCACCCCT miRNA* GAGTGAGCCTGAGAACACAAG mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
AGGAGTGAGCCTGAGAACACAAGCTGAATTGGTTTGAATTGCCATATCACATACTGATATCTGGTATAGGCTTTATGTTGCTAATTTATTTTGTGTTCTC
AGGTCACCCCT
dot-bracket secondary structure
(((.((((.((((((((((((((.(((((((((.......(((((((((.(((....))).)))))).)))........))))))))).)))))))))))
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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AGGTCACCCCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase gma-MIR398b: 0.0000003 PMRD gma-miR398b: 0.0000003 microPC miR398: 2e-58 | UniProt no hits RFAM MIR398: 2e-21 |
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