ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: microPC, original name: miR806
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG miRNA* CCGTTGACATTTTAAGCACATGT mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
CGCCGTTGACATTTTAAGCACATGTTTGACCGTTCGTCTTATTCAAAAAATTTAAGTAATTATTAATTCTTTTCCTATCATTTGATTCATTGTTAAATAT
ATTTTCATGCAGGCATATAATTTTACATATTTCACAAAAGTTTTTGAATAAGATGAACGGTTAAATATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR806h: 1e-75 PMRD osa-miR806h: 1e-75 microPC miR806: 3e-104 | UniProt no hits RFAM MIR806: 3e-80 |
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