ABOUT THIS RECORDspecies: Ricinus communis
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Ricinus communis Ricinus Acalypheae Acalyphoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* AGCTCCTTGAAGTCCAATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGATGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATAAGCAGAGATTATAATTTTGGATAGG
CTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTGTATTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 2e-93 PMRD ptc-miR159b: 5e-29 microPC miR159: 2e-93 | UniProt no hits RFAM MIR159: 3e-92 |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST044913) |
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