ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica rapa
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Brassica rapa Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* GGCTCCTTATAGTTCAAACG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATATATAAAAAGGATTTGG
TTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 3e-98 PMRD bra-miR159a: 3e-98 microPC miR159: 3e-98 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-63 |
Identical with: bna-MIR159 from miRBase (MNEST040261) |
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