ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
miRNA family: MIR159
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTAAAGTTCAAACG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAGAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAACCTTAAACATAGAAAAAGGATTT
TGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase aly-MIR159a: 5e-75 PMRD bra-miR159a: 2e-68 microPC miR159: 1e-100 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-66 |
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