ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum subsp raphanistrum
source: microPC, original name: miR159
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* GGCTCCTTATAGTTCAAAC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTGG
TAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 2e-74 PMRD bra-miR159a: 2e-74 microPC miR159: 3e-98 | UniProt no hits RFAM MIR159: 8e-59 |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046710) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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