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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST046956
species: Arabidopsis thaliana
miRNA family: MIR167
source: PMRD, original name: ath-miR167m

Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
 GGTCATCCTGCAGCTTCA

mismatches: 2
bulges: 1
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pre-miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATCGCTACATACGACATACACACATCACTAAACTTCTTTATAATTTATGCACACACATACAGCTCTTAATGGCCAC
AACTCAAAGTTATAATTAGTGCATGATCTCTAGTTATTTGACTGCTTTTAATATATGTTTATGGATTCACGCATGTGTGTGTATGTACATAATTTACATG
CATGCACTTTGTGTATGGTACACATCAATTTGAACCCGTTCAAAATTCTGTTTTTATTAGTATATATATAGATGTATGTGGTGTGTGTGTCAGTGTGTGT
GTGTGTTTATAGATAGTAGTACTAGGTCATCCTGCAGCTTCA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase ath-MIR167d: 2e-156

PMRD ath-miR167d: 2e-156

microPC miR167: 0.00002		UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 8e-153

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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
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