ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
source: PMRD, original name: ath-miRf10079-akr
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGT miRNA* ACTCGACTTCCAGGTTGAGTGAC mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGTCAGGAGATACTCGACTTCCAGGTTGAGTGACGAGGTCGAGTGGTTGTCTGATGATGGAGGTGAAGACACTCGACCTCATGGTCGAGTGATGTGATCG
AGTGATGGAGATGAGGGCACCCGACCTCGTGGTCGAGTGGTGAAGTGAAGTGGTGATGTCCTCTACTCGACCTGGGGGTCGAGTGGTCTCTTGAGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ath-miRf10205-akr: 4e-73 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR854: 0.0002 |
Identical with: ath-miRf10398-akr from PMRD (MNEST047498) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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