ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
source: PMRD, original name: ath-miRf10333-akr
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACTCGACCTGGAGGTCGAGT miRNA* TCGACCTCGGGGTCGAGTGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTGAAGACACTCGACCTCGGGGTCGAGTGATCTGATCGAGTGATGGTCAGGTGGTGGGGATGAAGACACTCGACCTCGGGGTCGAGTGGTGAGGTGAAGT
GGTGGTGTCCTCTACTCGACCAGGGGGTCGAGTGGTCTGCTGAGGTTGTGAATCGTCTACTCGACCTGGAGGTCGAGTGGTTTTGC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ath-miRf10084-akr: 3e-86 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR854: 0.000000000003 |
Identical with: ath-miRf10662-akr from PMRD (MNEST047762) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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