ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
source: PMRD, original name: ath-miRf10404-akr
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCATTTTGTGGGGACTGAGA miRNA* TCACTCCCCACAAAATGGAA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAATCTCTATTTCACTCCCCACAAAATGGAAGTTAATGTCCAGTTTTTCCCTAAATCGAAAGTTTGAATTCTAAGAGTTCGTAAGACTTGTTCGTTTGAT
TTGATCTATAATGAAATTGGACTTTAACTTCCATTTTGTGGGGACTGAGATAGACATTC
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ath-miRf10734-akr: 6e-87 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
Identical with: ath-miRf10734-akr from PMRD (MNEST047834) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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