ABOUT THIS RECORDspecies: Arabidopsis thaliana
source: PMRD, original name: ath-miRf11176-akr
Taxonomy by NCBI:
Arabidopsis thaliana Arabidopsis Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGACCTGGGGGTCGAGCGA miRNA* CTCGACCTCTTGGTCGAGT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CACTCGACCTGGGGGTCGAGCGAGGTGATCGAGTGGTGTCAGAAGATACTCGACTTCCAGGTGGAGTGAAGAGGTCGAGTGGTGAAGTGAAGTGGTGATG
TCCTATGCTCGACCTGGGGGTCGAGTGGTCTCTTGGGATCTTGAAGCTCCTGCTCGACCTCTTGGTCGAGTG
dot-bracket secondary structure
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CACTCGACCTGGGGGTCGAGCGAGGTGATCGAGTGGTGTCAGAAGATACTCGACTTCCAGGTGGAGTGAAGAGGTCGAGTGGTGAAGTGAAGTGGTGATG
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ath-miRf10605-akr: 1e-94 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
Identical with: ath-miRf10606-akr from PMRD (MNEST047706) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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