ABOUT THIS RECORDspecies: Chlamydomonas reinhardtii
source: PMRD, original name: cre-miR914
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii Chlamydomonas Chlamydomonadaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CGGGCGCGCCGGAATCCGTGG miRNA* ACGGATTCCGGCGCGCCCGGG mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
GCCGGACGTTACGGCATGACGACTCACGGCGTGACGCTGAACTTGTGACGATCGCCGTTTTAATTCGGGGGACCTATAGGCATTTGTTAACTCATAATCG
TTTTAAATCGCTCCGGATCTATAGCGAGCTGGGTGCGGGCGACCATCGCGCTCGAGCTGCAACTCGCCCGGGCACCTGCAAAGCTCGGCGAGCACCATCG
TTAAATACTTCGTACCATTCTATCTCTGCACCTAAACGTGTGCAGCTGAGTCCGCGCGCGGCCCCTCGCTGCTGATGCCGGGGGCGCCCCCCGCGCCTGT
CCCCGCCTCCCCTCCACGGATTCCGGCGCGCCCGGGGGTTGGTAATGGGTGCTAATGCGTGTGGCAGCACGGCGTACATTTGCCAGTTGCATCTGGAATG
CTCAGGGCTGGCCTGCTCTGCCCTAGCCTGGCCCTGCCCTTGCACAGGGCACCCCTGCTGCAGTCACTTGCTGCGGCTAAGCACGGCTGCAACCCGTGGG
GGGCGCTGCCGATTGACGCGAATGCAAGAGATCGGAGGCCCGGCACCCATTACCAACCCCCGGGCGCGCCGGAATCCGTGGAGGGGAGGCGGGGACAGGC
GCGGGGGGCGCCCCCGGCATCGGCAGCGAGGGGCCGCGCGCGGACTCAGCTGCACGCGTTTAGGTGCAGAGATAGAATGGTACGAAGTATTTAACGATGG
TGCTCGCCGAGCTTTGCAGGTGCCCGGGCGAGTTGCAGCTCGAGCGCGATGGTCGCCCGCACCCAGCTCGCTATAGATCCGGAGCGATTTAAAACGATTA
TGAGTTAACAAATGCCTATAGGTCCCCCGAATTAAAACGGCGATCGTCACAAGTTCAGCGTCACGCCGTGAGTCGTCATGCCGTGACGTCCGGC
dot-bracket secondary structure
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((.((.(((((..((((......))))...(((....((..((
((((((((.((((.(((.......)))..))))..)))))......)))))..)).((((((((.....))))))))...)))..))))).)).)))...
((((.((.((((((...((....))....)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
download this record
references
[1] Zhao T, Li G, Mi S, Li S, Hannon GJ, Wang XJ, Qi Y, Genes Dev. 21:1190-1203(2007)., "A complex system of small RNAs in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii"
GCCGGACGTTACGGCATGACGACTCACGGCGTGACGCTGAACTTGTGACGATCGCCGTTTTAATTCGGGGGACCTATAGGCATTTGTTAACTCATAATCG
TTTTAAATCGCTCCGGATCTATAGCGAGCTGGGTGCGGGCGACCATCGCGCTCGAGCTGCAACTCGCCCGGGCACCTGCAAAGCTCGGCGAGCACCATCG
TTAAATACTTCGTACCATTCTATCTCTGCACCTAAACGTGTGCAGCTGAGTCCGCGCGCGGCCCCTCGCTGCTGATGCCGGGGGCGCCCCCCGCGCCTGT
CCCCGCCTCCCCTCCACGGATTCCGGCGCGCCCGGGGGTTGGTAATGGGTGCTAATGCGTGTGGCAGCACGGCGTACATTTGCCAGTTGCATCTGGAATG
CTCAGGGCTGGCCTGCTCTGCCCTAGCCTGGCCCTGCCCTTGCACAGGGCACCCCTGCTGCAGTCACTTGCTGCGGCTAAGCACGGCTGCAACCCGTGGG
GGGCGCTGCCGATTGACGCGAATGCAAGAGATCGGAGGCCCGGCACCCATTACCAACCCCCGGGCGCGCCGGAATCCGTGGAGGGGAGGCGGGGACAGGC
GCGGGGGGCGCCCCCGGCATCGGCAGCGAGGGGCCGCGCGCGGACTCAGCTGCACGCGTTTAGGTGCAGAGATAGAATGGTACGAAGTATTTAACGATGG
TGCTCGCCGAGCTTTGCAGGTGCCCGGGCGAGTTGCAGCTCGAGCGCGATGGTCGCCCGCACCCAGCTCGCTATAGATCCGGAGCGATTTAAAACGATTA
TGAGTTAACAAATGCCTATAGGTCCCCCGAATTAAAACGGCGATCGTCACAAGTTCAGCGTCACGCCGTGAGTCGTCATGCCGTGACGTCCGGC
dot-bracket secondary structure
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((.((.(((((..((((......))))...(((....((..((
((((((((.((((.(((.......)))..))))..)))))......)))))..)).((((((((.....))))))))...)))..))))).)).)))...
((((.((.((((((...((....))....)))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
download this record
references
[1] Zhao T, Li G, Mi S, Li S, Hannon GJ, Wang XJ, Qi Y, Genes Dev. 21:1190-1203(2007)., "A complex system of small RNAs in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii"
