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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST048612
species: Glycine max
miRNA family: MIR2675
source: PMRD, original name: gma-miR1525

Taxonomy by NCBI:
Glycine max Glycine Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TGGGTTAATTAAGTTTTTAGT

miRNA*
TAAAAACTTAATTAATCCTAT

mismatches: 1
bulges: 0

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pre-miRNA
TATATAATTTTGGGTTAATTAAGTTTTTAGTCCCTATAAATATTCATAGTTTTGTTTTTAGTCCCTACAAAATAAGATCACACTTTTTAGTCCTTGTGAC
ATTTTCCTTAAGCATTTTAGGGACTAAAACTGTTGATGAAATTTTTTTACAGGGACTAAAAGTGCCGATGAAAAAATTTATAGGGACTAAAAAGTATGAT
TTTATTTTGTAAGGACTAAAAACAAAACTGTGAATATTTATAGGACTAAAAACTTAATTAATCCTATAATTTTT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase gma-MIR1525: 8e-143

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits

MORE

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non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
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references

[1] Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots"




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