ABOUT THIS RECORDspecies: Glycine max
miRNA family: MIR1521
source: PMRD, original name: gma-miR1529
Taxonomy by NCBI:
Glycine max Glycine Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTAAAGGAAACAATTAATCGTTA miRNA* ATCATTAATTGTCTACCTTCACTATTTTATTAAACGTTTATC mismatches: 5 bulges: 19 |
pre-miRNA
AATTAGATGTTAATCATTAATTGTCTACCTTCACTATTTTATTAAACGTTTATCGTTACATGTCACGATTTTATTAAACATTAATTTTATGTACCTAATT
AACGTTAACTTCCAATAAAATTAGGATGCGTGATAATCAACATTTAATAAAAGTACGACACTTAACGATTAAAGGAAACAATTAATCGTTAACGTTCAAT
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[1] Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots"
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SIMILARITIES| miRBase gma-MIR1529: 6e-112 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
Identical with: gma-MIR1529 from miRBase (MNEST040528) |
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[1] Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots"
