ABOUT THIS RECORDspecies: Gossypium raimondii
source: PMRD, original name: gra-miR172b
Taxonomy by NCBI:
Gossypium raimondii Gossypium Malvoideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAAATCTTGATGATGCTGCAT miRNA* GCAGCTGCAGGGTTCT mismatches: 5 bulges: 3 |
pre-miRNA
AAAATCTTGATGATGCTGCATGAAAAAACAGTGGCATTAGTGTAGTACTGACCTGACCGTGCATTTGCCACGGCCAATCAGGGACACGTTGTGGAGGATC
GAATTCAACCGGTTTCACCATTGTTCTTTCCTCACTAGGAAAAAATCTCGGATATGCACTATTCCAAAAAATAGGCTGATCTGAAGTCCCCGCTAACCCT
TGGAAAGATGGAACACTAAATGTTGCAGCTGCAGGGTTCT
dot-bracket secondary structure
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AAAATCTTGATGATGCTGCATGAAAAAACAGTGGCATTAGTGTAGTACTGACCTGACCGTGCATTTGCCACGGCCAATCAGGGACACGTTGTGGAGGATC
GAATTCAACCGGTTTCACCATTGTTCTTTCCTCACTAGGAAAAAATCTCGGATATGCACTATTCCAAAAAATAGGCTGATCTGAAGTCCCCGCTAACCCT
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD gra-miR172a: 7e-72 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
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