ABOUT THIS RECORDspecies: Liriodendron tulipifera
miRNA family: MIR159
source: PMRD, original name: ltu-miR159
Taxonomy by NCBI:
Liriodendron tulipifera Liriodendron Magnoliaceae Magnoliales magnoliids Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* ATGCTCTTTTACTCCTTGGT mismatches: 9 bulges: 1 |
pre-miRNA
CTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACCATGCTCTTTTACTCCTTGGTGTTTGGCCTACTGGTTTGGTGGGCCACTGTTGATCTGCTGTAGACCAGATCAACG
GCTAGGATTCCTGCAAATCAGCATCCTCTTTTTATTGGAAATAAAACTGATGTTGTCATGAAATTCTTTGTAAGCATGCTCCACCCTTGTTCTTCAGTTG
TATTCAGTGTGTGGCCCATCCACCATGAGGCCTGCTCGATGAACTGCTTCGATTCGCAGATGTTCTTTTGGAAGATTTTACTGTTCTTTACTTTAATTTT
AATGAGCGTTAACGGGTGGATCTCCCCTTGCAGGAAATTGATATC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR159c: 1.0E-6 PMRD vvi-miR159c: 1.0E-6 microPC miR159: 0.0003 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 2.0E-5 |
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