ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR159
source: PMRD, original name: osa-miR159m
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG miRNA* GAGCTCCTTTCGGTCCAAAAAGG mismatches: 2 bulges: 2 |
pre-miRNA
TTGAGCTCCTTTCGGTCCAAAAAGGGGTGTTGCTGTGGGTCGATTGAGCTGCTGGGTCATGGATCCCGTTAGACTACTCCATGTTCATCATTCAGCTCGA
GATCTGAAAGAAACTACTCCAATTTATACTAATAGTATGTGTGTAGATAGGAAAATGATGGAGTACTCGTTGGGATAGGCTTATGGCTTGCATGCCCCAG
GAGCTGCATCAACCCTACATGGACCCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR159a: 2e-131 PMRD osa-miR159a: 2e-131 microPC miR319: 0.000003 | UniProt no hits RFAM MIR159: 3e-130 |
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