ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
source: PMRD, original name: osa-miRf11557-akr
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCCTTGAGGAGGTACCATGAGGTAT miRNA* ACCTCATGGTACCTCCTCAAGGACC mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
AATTTTACGGTCCTTGAGGAGGTACCATGAGGTATCACTTTTTTTATTGTAAATTTGGTACCTCTTGGTACCTAGGTACTATGAGATACCATGAGATACC
AAATTTTACACTATATTTTTGGTACCTCATGGTACCTCCTCAAGGACCGTAGAATT
dot-bracket secondary structure
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......((.(((((((((((((.(((.(((((.((..........)).))))).))).))))
))).)))))).))......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
download this record
AATTTTACGGTCCTTGAGGAGGTACCATGAGGTATCACTTTTTTTATTGTAAATTTGGTACCTCTTGGTACCTAGGTACTATGAGATACCATGAGATACC
AAATTTTACACTATATTTTTGGTACCTCATGGTACCTCCTCAAGGACCGTAGAATT
dot-bracket secondary structure
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.......((.(((((((((((((.(((.(((((.((..........)).))))).))).))))
))).)))))).))......)))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf11556-akr: 1e-72 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets
HuntMi prediction: true miRNA
additional data
download this record
