ABOUT THIS RECORDspecies: Populus trichocarpa
source: PMRD, original name: ptc-miRf10862-akr
Taxonomy by NCBI:
Populus trichocarpa Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATATTGGGACCTCACCTAAT miRNA* TAGGTGATGTCTCAATATAT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TATAAATCATATATTGGGACCTCACCTAATAGTTTAAGCTCTTGTAAATCATATATTGGGACCTCACATAATAGCTTAAGCCAAGAGCTTAAGCTATTAG
GTGATGTCTCAATATATTATTTATA
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: true miRNA
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GTGATGTCTCAATATATTATTTATA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR481b: 0.0004 PMRD ptc-miRf11431-akr: 0.0001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
MOREmiRNEST target predictions: none
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