ABOUT THIS RECORDspecies: Populus tremuloides
miRNA family: MIR167
source: PMRD, original name: pts-miR167
Taxonomy by NCBI:
Populus tremuloides Populus Saliceae Salicaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAAGCTGCCAGCATGATCTG miRNA* GGTCATCTAGCAGCTTCA mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATGAACGTGTTACTCTCATTTATATATATATTAACATTAATCTTATAGCAGTATCTGTAGGTAGAAAAAATTTAAT
GTTGTCAAAGATATATACTGAATCGTGGTTGCTAGGTTTGTATTACTAGTTTAGGATGCATGTTTTTGATCTTATGATGATCAATTGCTTGTGAGTTCCT
AGGCAATGAAAACAGAATATATACTGGTGATTTTTCCCAGTAAAATTGTCGAGAAAAGGGAATTGCACTAATAGGGAAGACGCATAGGTAAACTTGTATC
TAAATGGTATATGTATNTTCCAGGCAAAAGGGTAGAAACCTAATNAGAAACTAGCTTGAACTCAGAGCTATAAAAGTATATGGTTCCATCAGGTCATCTA
GCAGCTTCA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR167c: 0.0000004 PMRD ppl-miR167b: 0 microPC miR167: 0.00002 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 0 |
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