ABOUT THIS RECORDspecies: Phaseolus vulgaris
miRNA family: MIR159
source: PMRD, original name: pvu-miR159
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus vulgaris Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAATTG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATTGAGGATCTTACTGGGTGGATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCTACCCATCAGCATGTTTTGTGGTAGTC
TTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATCTGCCTCTATAGTATCATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase pvu-MIR159a: 7e-96 PMRD pvu-miR159: 7e-96 microPC miR159: 5e-69 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-20 |
Identical with: pvu-MIR159a from miRBase (MNEST041023) |
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