ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum propinquum
miRNA family: MIR159
source: PMRD, original name: spr-miR159
Taxonomy by NCBI:
Sorghum propinquum Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG miRNA* TCGGTTTCCTATTCGTACCCTG mismatches: 7 bulges: 3 |
pre-miRNA
TTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCCTGATCCATCCATTCCATCCCCCCATGCTTGCTTTGTTTATTGGCTGTTCCTGAGTGAGATCTGAGGCTCATGGC
TCTATGTAGCCATGGATTTTTTTTCCCTTTCTCCTAACTGCTGCTGCTGTTTCTCCAAGATTCAATAGGCTGTTCTGCCGTGCTTATCCGTGCTGGAGCT
GGATGAAGCAAGCTGCTTTGCTGCTGCCCTCATCCTCATGCCCTGGATGATGGTGGTGTGGTGTGGTATCGGTACCCCGTACTTGCGTCGCTTTATTCCT
ATCTTTGCTGGTGAGGTGTTATGTCAGTACAGTAGTTTATGTCACCCTCGTTTATCTTGTTCTATATGCTTCGGTTTCCTATTCGTACCCTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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SIMILARITIES| miRBase ssp-MIR159a: 0.00000000000002 PMRD sof-miR159d: 0.00000000000002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.0000000004 |
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