ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
source: PMRD, original name: tae-miR156b
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGAGAGCAC miRNA* GCTCCTCTTCTTCTGGTCGA mismatches: 3 bulges: 3 |
pre-miRNA
TGACAGAAGAGAGAGAGCACGCTGAAGATCCGGTGCTCCACCTAATTTTGAAGCGGTTACAGATGCGTCCGGACCTTTCATTGGTAGCAGCTCAGCTATG
TCATGACTCAGTGCTGGAACAGCATTGGGTAGATGAGATTTATCAAAATGAACTTGTCCATTGATTGATACTTCTCTTATTTCCTTCACTTGCGGGAGCT
TGAAGTCAGATGGGCTGTCCCATGGAGAACATGGGAAAGGCCTTGCATGGCTGAGTGGATCTTTATTCCAGACAAAACTTATTTGCCGTCTATCATCAAA
CACCAATGACGACGGGAGCCTTGCCGGTGTAAAGGAGAATGCGTCTGGCTGTGGTTTCCGGCGCCGAGCATTGTGATCGGACAGCCGCCTCCGGCAGCTC
CTCTTCTTCTGGTCGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD tae-miR156a: 1e-22 microPC no hits | UniProt sp|Q653Z5|SPL11_ORYSJ: 2e-34 RFAM no hits |
Identical with: tae-miR156a from PMRD (MNEST054671) |
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