ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
source: PMRD, original name: tae-miR2009c
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCAGATGAGAAGGCAGATCATAATA miRNA* TTATGATCTGCTTCTCATCTGAAG mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATATTGTTGCTCAATTGTTATGATCTGCTTCTCATCTGAAGACTAGTTTATTACATATAAGCTATTCTTGGAAGTTTGAGAGAGAGATCACAAGCAGATC
TTCTTCCACTTCGAGAAATATGTTTAGATATTATAAANCAGTCTTCAGATGAGAAGGCAGATCATAATAGCTGAGCAGTAATAT
dot-bracket secondary structure
(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((......(((((((((..(.(((((..(.(((..(((((.......))))
)..))))))))).)..)))).)))))......))))).))))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
download this record
ATATTGTTGCTCAATTGTTATGATCTGCTTCTCATCTGAAGACTAGTTTATTACATATAAGCTATTCTTGGAAGTTTGAGAGAGAGATCACAAGCAGATC
TTCTTCCACTTCGAGAAATATGTTTAGATATTATAAANCAGTCTTCAGATGAGAAGGCAGATCATAATAGCTGAGCAGTAATAT
dot-bracket secondary structure
(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.((((((......(((((((((..(.(((((..(.(((..(((((.......))))
)..))))))))).)..)))).)))))......))))).))))))))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD tae-miR2009a: 7e-22 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
download this record
