ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
source: PMRD, original name: zma-miR167u
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAAGCTGCCACATGATCTG miRNA* GATCAGGCTGGCAGCTTCA mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGAAGCTGCCACATGATCTGATGACGCAGAGTCATGCATATGCATTGCATCCAGCAAGCTCCATGCGTGCGTGCATGGCCGAATGGCCGAAGAGACTAGC
TAGTCCATCTCTCCAAGGCCATCCACGTGTGAGAATTCAATTCCTCGTGGATCAGATCAGGCTGTTGTTGACAACTGCATGCCGCACCTGCACTACAGCA
ACCCAAGGCATAGGTAGCTAGCTAGGTTTCGGTGGTCAGATCAGATCAGGCTGGCAGCTTCA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR167f: 0.0002 PMRD zma-miR167l: 0.0002 microPC miR167: 0.00005 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 0.0002 |
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