ABOUT THIS RECORDspecies: Vitis vinifera
miRNA family: MIR169
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Vitis vinifera Vitis Vitaceae Vitales rosids incertae sedis rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAGCCAAGGATGAATTGCCCA miRNA* GGCCTCCATCTTTGCTC mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
CGAAAGTAACAAAGCCAAGGATGAATTGCCCAGACCAGTGACTCCATCGATCTTGTTCCTATCGACTTCTCACCGGACAACCAGGAGCAGGACTCCATTG
CCCATAAGTCCCACCGCCACCACCTTGCATGGCTCCACCCATGTGGGGAGACATGCCTGAGAACCTGTGCTCCGGCTGCCTGAAAAGGACATCACTGTTA
GAGACACTGGTGACATCAGAGCTGGATGTAGTTGAAGCAACAAATTTGCCAGTATCAGACTGATGGACTTCATACTCAGTTGTGTCTCCCTTCTGGTGAA
AATGACCAGAGCCAGATACACTATGACAGCCAGCATTGGAAGTTGAGTCCGGTTCTTGGAGCTTTTTCGTGCTGAGGAAGCGTCCACCAGATCCTCTAAC
CCTATTTAGGGCATGAAGATGCCGAGACTCGTGCAATATGGCTTTCGGGCTTTGACAAGTTTGTTCTGGGCCTCCATCTTTGCTC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR169v: 0.00003 PMRD vvi-miR169v: 0.00003 microPC no hits | UniProt sp|Q9SYH4|NFYA5_ARATH: 0.000000000001 RFAM MIR169_2: 0.0005 | most similar mature miRNAs |
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