ABOUT THIS RECORDspecies: Vitis vinifera
miRNA family: MIR156
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Vitis vinifera Vitis Vitaceae Vitales rosids incertae sedis rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGAGAGCACA miRNA* TTTTTTTTTTTTTTTAGG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTACAGCGGGCCCNCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGTCTCAAAAACAAAGATCAAGAGCCACTTTTGTTTTTCCCAGCAAAACAATGATCAAGA
ACCATTTGGTTTTTCTCCTAGCAAAACACAAGATCAGGAGGTATCCACCTGAAGGATATTCGTAAGTAGTTTTTTGAACCAAAGCTGTTAAAGGTGTTCA
TACAAACCAGATGGTAAGTTGGCACCTAAAGTGACCAGTGCATCTGCTGAGTGGAAGAGTCATAAGCCCTGGAGTGCTCGAGTTCCATGTATTGCCTTCC
ACTCTGTTGGGGCAACTCGCCCCCACCTGAGAACTGGCTATTAATAGGCTGTGAAATTTGACCAAGACCAAGATCAGGTGGCATCTCCTGCGAACTGCTA
CTACCTTCATTGCCCTTGAAATCCCACGAGGTGCTTGGGAAGTGATTGATAGCTGCACTATGAGGAGCTGTGGGTTGCGCCATGGATGCCCCTTCAGGAT
TCATGAAGCTGTTTGCTCCAAGACCAGATGCTCGATTCCTGGAGCTCCATGGCTGATTTGACAGAAGAGAGAGAGCACAGCTTGAGTCGGAGGCCCCTGT
GAAACATT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR156: 0.0000000000001 PMRD bdi-miR156: 0.0000000000001 microPC miR157: 0.0001 | UniProt sp|Q700W2|SPL9_ARATH: 0.000000002 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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