ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGTTACTCCCTCCGTTCCAAA miRNA* CTGAATGGGGTGGAGTAGCTTT mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
AAATTAAGGTTAGTTACTCCCTCCGTTCCAAAATGTAGCAGTGACTTCTGCTCCGAGACTTACGCACCATGACTCTGAACAACCACTAATGTGCCAATAT
GTCAGGGTGGAGACAACACCTTAAAAATGGCTTTTATCTTGGCAACACCACAGTGAAAATAGATCTTCAAGTTCACGGACAAGTGCAAACAGAACAGCTG
TGGCCTGCATAGTGCTTGCAGGGCTTCCATGTTTGCACCCCAGGTCACAGAGCTGCTTGAATCATGCTCTGAGCAGTCAGATAATAAAGTAATGGGACGA
TCTCATTCTACAGCTGCAGCCATCTGCCATTATGCAGACTTGAATCCATGTCAACAACTCGTGTGCATACAAAGGTACCAGAAGGGGAGGCTCGTAGTCT
TTTTCAATACAATCAGACGCAATTGCTGAATTAGTTTTAGGAGTGTTTAAGAGCAACTAATGCCATCGGGGGAGCTGCTGGGCCCTATTGTATATAGCGG
TGACAGTCTGACAGATGTAGCTGAATGGGGTGGAGTAGCTTTGCTTATCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1137: 0.0005 PMRD osa-miRf11780-akr: 0.0001 microPC miR1439: 0.00003 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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