ABOUT THIS RECORDspecies: Picea sitchensis
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Picea sitchensis Picea Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTGGATTGAAGGGAGCTCCT miRNA* GCGCTTCCTTCAACCCAATAA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAAGAAGCAAGAGCTGACGGGGCGCTTCCTTCAACCCAATAAATGGCTGTGTAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGATTCTATTACATTGTCACGTT
GCTGGAGCTATTTTTCGTGGCAAGATAATGGTGTGCATGGCACAGGAGTTGGAATGCCACTATGCGGCGTTATATTGGATTGAAGGGAGCTCCTCGCAGG
CCTCGTGCTGGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR159b: 0.0000000007 PMRD pta-miR159b: 0.0000000007 microPC miR159: 0.0000000007 | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.0008 | most similar mature miRNAs |
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