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Species belonging to selected taxon:

Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Zea mays, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002469
species: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf75
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GTCGAGACGAATCTTTTGAGC

miRNA*
 TCAAAACATTCGTCTCACAA

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 AAATTTTACAAGATTCCTCATCACATCGAATCTTTGGACGCATGCATGGAGTATTAAATGTAAGTAAACAAAATAACTAATTGCACAGTTTGTCTGTAAA
TGTCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAGTCCATGATTGGATAAATTTTACCAAATAACAACGAAAAGTGCCACAGGGACTTTACACCAACTTTTACAC
CATCTAAACACTACCTAAATCATACTATCATGTGGGATAGCAGCTGGTTGAGCAACAAGTTCAATTATACATACGTGCGTTGTTGTTTAAGCTACCTAAT
AGTACTGTAGCCGCCCCTGTGAAATTAAGGCTGTGTTTAGATCTAAATTTTGAAGTGCCCAAATACACTGTAGCCATTCGGTTGTATTTGGTAATAATTG
TCCACCATTGACTAATTAGGCTCAAAACATTCGTCTCACAAAGTACAACCAAACTGTACCATTAGTTTTTGATTTTATTCACATTTAGTATTTCATGCAT
GTATTCGAAGGTTTGGTGTGACCGGAAAATCTTTTTTTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124h: 0.000000000002

PMRD osa-miRf11301-akr: 0.000000000008

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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