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Species belonging to selected taxon:

Taraxacum kok-saghyz, Taraxacum officinale



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002701
species: Taraxacum officinale
miRNA family: MIR1122
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Taraxacum officinale Taraxacum Crepidinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TACTCCCTCCGTCCCAAATTA

miRNA*
 ATTTGGGACGGAGGTAGTATG

mismatches: 1
bulges: 0
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pre-miRNA
 AGAGATCTACTATGACTTATGAGGAATAGCTGCTTATTAATTACTCCCTCCGTCCCAAATTAATAGTCCACTTTTGACTTTTCAAAGTCTTATTCTTTCA
ACTTTGACCACATATAATATTGTTTATACTATACTCCGTATAATTTTTGATACAAAATATATAAATAGATTATGTTTTACATGTAAATTTTTATTGGTAT
AAGTTTCATTAAAAATTATATAACACAAAAAAAATTATTTATGGTCAAAGTTGAATAAACAAGACTTCAAAAAGTCCAAACTGAACTATTAATTTGGGAC
GGAGGTAGTATGATTTATCGGTTATTGAATCAAAGTTGTAGCCTTTATAT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.0003		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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