ABOUT THIS RECORDspecies: Trifolium pratense
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Trifolium pratense Trifolium Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTTGGGACAGAGAGAGTAAT miRNA* TACCCTCTGTCCCAAAATA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
ATATGCCTATTAAGTACCCTCTGTCCCAAAATATAAGCAAAAAGGGGTCAACAAAAGTGAATGTATTTGGACTAAATTTTAAACCAAATTCATCAACTTT
CGTTGACCACTTTTTGCTTATATTTTGGGACAGAGAGAGTAATATATTATATAG
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf10603-akr: 0.000008 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 2e-19 | most similar mature miRNAs |
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