ABOUT THIS RECORDspecies: Triphysaria pusilla
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triphysaria pusilla Triphysaria Rhinantheae Orobanchaceae Lamiales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AATACTACCTCCGTCCCAAAA miRNA* TTGGGACGGAGGGAGTATAAC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCAAACTTTAATACTACCTCCGTCCCAAAAGATTGTCCGGTTTTGACTTTTTCAAATATTTAAGAATTTATTGACTTTTATGATGTGAGATTGCGGCGGA
TGAAGACGTCAATGTCTCCCGCCACCGTCCTAGCATCGCGAGAGGGTATCTTTAGGATTTTGTTCAAAAAATAATCAAATTGGACTAGTTTTGGACTAGT
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 0.00005 PMRD osa-miRf10322-akr: 0.000003 microPC miR1439: 0.00005 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00006 | most similar mature miRNAs |
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