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Species belonging to selected taxon:

Volvox carteri, Chlamydomonas reinhardtii



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002830
species: Volvox carteri
miRNA family: MIR414
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Volvox carteri Volvox Volvocaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ACATCATCATCATCATCATCA

miRNA*
 GTGGTGGTGGTGGTGGGGCAT

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 TGCATCGCACTACATCATCATCATCATCATCATCATCATTTCGGCATTCTTGGGACGACACACACATACACACACACACACGCGCGCGCGCGTGCCTATC
CACGACATTTACATAGATATATAGCTCTCCTACATGCATGCGTAGTGCATGCATGTACGGGGATGGGGGGGGAAACCGGAGGGGAAGAAATGTGCGGCCG
AACCAAAGGTGATGACGAGATGCGCGCGGCGGTGTGGCTGCATCTATCTACGTGAAACGGTGTTTCACGTGGTGGTGATGGTGATGAGTGTGATGGTGAC
GATGATGGTCGTAATGACAGCGATGATGATGATGCCGATGCTGATGCTGATTTTAAGGATGTCGCGGATAGGCGTGCGCGGGCGCTGCTGCTGCTACTGC
TGCTGCTGCTGCTGCTCTGTGTGTTCCAGACTGGTGGGGAGGCCTTCCGGACGTTTTAGAGCCTTTTACGCCTCCTATCAGCTGCCCGCTACCCCTCCTG
GCCCCTCCCTTCTCTCATCTACCTCGCGGTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGGTCATC
GCACCATCGGGCTCATAGCGATTTCCAGCAGGACTAACTGCTGCTCGCGAGATCTCCACAACCGGTGACATTTTGCATACGCATTTTTGTTGTTTTGGGG
TTTACTCCGGGGGATTCGTTCCCCGGGTAGTTTGAGGTGCCTGCCGTTTTTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGCATTGCGACTG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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